Черепашки-ниндзя: Погром мутантов

История о четырёх черепашках-ниндзя, что всю жизнь прожили в канализации Нью-Йорка. Там их обучал превратившийся в крысу человек Сплинтер, и вместе они пытались справляться со всеми трудностями. В самой канализации их немало: начиная от страшных мутантов, и заканчивая людьми, которые иногда бывают хуже монстров. И всё же повзрослев, черепашки-ниндзя не могут больше игнорировать окружающий мир. Попав в реальный Нью-Йорк, они сталкиваются с проблемами, которые до этого были лишь в воображении.

Ведь человеческий мир порой жесток, и в нём нет места для мутантов-подростков. Однако главные герои решают не опускать руки, а продолжать вести себя как обычные подростки, знакомится с иными личностями, и искать себе место для жизни. Вскоре им удаётся познакомиться с репортёром Эйприл О Нил, а затем все вместе сражаются против зла, и становятся настоящими друзьями. Правда не зная о том, что это лишь начало пути, и вскоре черепашкам-ниндзя предстоит столкнуться с новыми проблемами, где так или иначе может помочь только ниндзюцу и желание защитить весь мир от страшной опасности. Но они со всем справятся, ведь Сплинтер их хорошо обучил, и с этими знаниями готовы к подвигам.